Laboratoriokäsikirja
Tutkimukset aakkosjärjestyksessä
Bakteeri-, home- ja hiivaviljelyt, aerobi ja anaerobi
Bakteeriviljely tehdään bakteeri-infektiota epäiltäessä. Avoimille, ilman kanssa kosketuksissa oleville tulehduksille riittää aerobiviljely, mutta esimerkiksi leikkaushaavoista, syvistä haavoista, paiseista ja puremista kannattaa aina pyytää lisäksi myös anaerobiviljely.
Huolellisesti ja puhtaasti otettu näyte on oleellinen tulosten oikeellisuuden kannalta. Mitä useampia bakteereita näytteeseen tulee, sitä suurempi riski todellisella infektion aiheuttajalla on peittyä kontaminaatiokasvun alle. Tällöin myöskään herkkyysmäärityksen tulos ei kuvaa antibioottien tehoa oikeaa taudinaiheuttajaa kohtaan.
Huomioi, että runsaan sekaflooran vuoksi nielu- ja sieraineritteet koiralla ja kissalla, samoin kuin hevosen trakealimanäyte yksinkertaisella katetrilla otettuna, ovat harvoin diagnostisia. Myös vapaasti lasketun virtsanäytteen bakteeriston tulkitseminen on diagnostisesti epävarmaa.
Arvioimme analyysikelpoisuutta tapauskohtaisesti, jos näyte on otettu muuhun kuin ohjeidemme mukaiseen kuljetusputkeen tai näytteen säilyvyysaika on ylittynyt.
Huom. Testaamme ja vastaamme mahdolliset resistenssibakteerilöydökset infektiokannoista (Enterobakteereiden osalta ESBL ja AmpC sekä Stafylokokkien osalta MRSA ja MRPS -testaus) ja lähetämme lakisääteisesti vaadittavat kannat Ruokavirastoon.
Huom. Laboratoriomme turvatason ja lainsäädännön mukaisesti voimme viljellä ja tunnistaa STM:n asetuksen 748/2020, biologinen tekijä luokitus 1–2 mukaisia bakteereja ja sieniä.
Ilmoitettavista eläintaudeista on ilmoitusvelvollisuus laboratoriolla, eläinlääkärillä ja omistajalla. Lisätietoja Ruokaviraston sivuilta.
Vastausaika:
- Bakteerien aerobiviljelyille 3–6 arkipäivää
- Bakteerien anaerobiviljelyille 6–10 arkipäivää
- Hiiva- ja homeviljelyt 14 vrk
Näytetyyppi:
Näytteet säilytetään viileässä ja toimitetaan laboratorioon mahdollisimman nopeasti.
Näyte säilyy:
- Bakteerinäytteenotto- ja -kuljetusputkessa (geeli, M40™ Transystem) 3 vrk
- Virtsa Urine CCM-/culture-putkessa 3 vrk
- Virtsa lisäaineettomassa putkessa jääkaapissa 1 vrk
Mainitse lähetteessä näytteenottokohta, mahdollinen antimikrobilääkitys, infektion työdiagnoosi ja mahdollinen bakteerilajiepäily. Mahdollisimman tarkat esitiedot auttavat laboratoriota löytämään todelliset taudinaiheuttajat.
Myös anaerobibakteerit säilyvät bakteerinäytteenotto- ja -kuljetusputkissa (geeli, M40™ Transystem). Näyte voidaan ottaa myös ilmattomaan ruiskuun tai anaerobiampulliin, jos infektionaihettajaksi epäillään ensisijaisesti obligatorisesti anaerobia bakteeria.
Katso tarkemmat ohjeet näytteenottoon täältä>>
Menetelmä:
Lähetetietojen perusteella näytealueella patogeeneina pidettävien mikrobien viljely yleis- ja selektiivisillä elatusaineille. Todennäköiset patogeenit tunnistetaan, ei tyypitetä. Tulkinta tulee aina suhteuttaa kliiniseen kuvaan.
Virhelähteet:
- Kuivunut näyte
- Kontaminoitunut näyte tai runsas normaalifloora
- Ennen näytteenottoa aloitettu antibioottilääkitys
- Vanhentunut näyte tai säilytetty lämpimässä
- Näyte on otettu tai toimitettu väärin
- Riittämätön näytemäärä
- Anaerobibakteerin elinkyvyn heikkeneminen kuljetuksen aikana
Lähteet:
Markey B, Leonard F, Archambault M, Cullinane A, Maguire D. 2013. Clinical Veterinary Microbiology, 2nd Edition.
Elintarviketurvallisuusvirasto Evira ja Helsingin yliopiston eläinlääketieteellinen tiedekunta. 05/2016. MIKROBILÄÄKKEIDEN KÄYTTÖSUOSITUKSET ELÄINTEN TÄRKEIMPIIN TULEHDUS- JA TARTUNTATAUTEIHIN
CLSI. Performance Standards for Antimicrobial Disk and Dilution Susceptibility Tests for Bacteria Isolated From Animals, 3rd ed. CLSI supplement VET01S. Wayne, PA: Clinical and Laboratory Standards Institute; 2015.
EUCAST. The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters.Version 6.0, 2016.
Albihn A, Båverud V, Magnusson U. 2003; Uterine Microbiology and Antimicrobial Susceptibility in Isolated Bacteria from Mares with Fertility Problems. Acta Veterinaria Scandinavica 44:121-129
Brooks D E. 2002; Equine Ophthalmology. AAEP PROCEEDINGS Vol. 48
Päivitetty: 7.7.2023
