Laboratoriokäsikirja

Tutkimukset aakkosjärjestyksessä

Takaisin hakutuloksiin

Bakteeri-, home- ja hiivaviljelyt, aerobi ja anaerobi

Bakteeriviljely tehdään bakteeri-infektiota epäiltäessä. Avoimille, ilman kanssa kosketuksissa oleville tulehduksille riittää aerobiviljely, mutta esimerkiksi leikkaushaavoista, syvistä haavoista, paiseista ja puremista kannattaa aina pyytää lisäksi myös anaerobiviljely.

Huolellisesti ja puhtaasti otettu näyte on oleellinen tulosten oikeellisuuden kannalta. Mitä useampia bakteereita näytteeseen tulee, sitä suurempi riski todellisella infektion aiheuttajalla on peittyä kontaminaatiokasvun alle. Tällöin myöskään herkkyysmäärityksen tulos ei kuvaa antibioottien tehoa oikeaa taudinaiheuttajaa kohtaan.

Huomioi, että runsaan sekaflooran vuoksi nielu- ja sieraineritteet koiralla ja kissalla, samoin kuin hevosen trakealimanäyte yksinkertaisella katetrilla otettuna, ovat harvoin diagnostisia. Myös vapaasti lasketun virtsanäytteen bakteeriston tulkitseminen on diagnostisesti epävarmaa.

Arvioimme analyysikelpoisuutta tapauskohtaisesti, jos näyte on otettu muuhun kuin ohjeidemme mukaiseen kuljetusputkeen tai näytteen säilyvyysaika on ylittynyt. 

Vastausaika:

  • Bakteerien aerobiviljelyille 2–5 arkipäivää
  • Bakteerien anaerobiviljelyille 5–10 arkipäivää
  • Hiiva- ja homeviljelyt 14 vrk

HUOM! Vastaamme mahdolliset resistenssibakteerilöydökset bakteeritutkimuksien osalta ja lähetämme lakisääteisesti vaadittavat kannat Ruokavirastoon.

Näytetyyppi:

Mainitse lähetteessä näytteenottokohta, mahdollinen antimikrobilääkitys, infektion työdiagnoosi ja mahdollinen bakteerilajiepäily. Mahdollisimman tarkat esitiedot auttavat laboratoriota löytämään todelliset taudinaiheuttajat.

Näyte säilytetään viileässä ja toimitetaan laboratorioon mahdollisimman nopeasti.  Näyte säilyy 3 vrk näytteenotosta.

  • Iho ja limakalvot
    • Poistetaan mahdollinen kuivunut erite/kudos. Märkäinen alue puhdistetaan huolella steriiliin fysiologiseen keittosuolaliuokseen kostutetulla steriilillä sidetaitoksella. Näyte otetaan hankaamalla näytteenottotikkua tai steriiliä vanupuikkoa infektiopesäkkeen pohjalla varoen kontaminoimasta tikkua ihon normaaliflooralla. Näytetikku suljetaan bakteerikuljetusputkeen (geeli, M40™ Transystem).
  • Korva
    • Näyte otetaan pyöräyttämällä näytteenottotikkua tai steriiliä vanupuikkoa korvakäytävässä ja sulkemalla tikku bakteerikuljetusputkeen (geeli, M40™ Transystem).
  • Silmän sidekalvo
    • Ylimääräinen märkä puhdistetaan steriiliin fysiologiseen keittosuolaliuokseen kostutetulla steriilillä sidetaitoksella tai pumpulipuikolla, jonka jälkeen näyte otetaan fysiologiseen suolaliuokseen kastetulla näytteenottotikulla tai steriilillä vanupuikolla varoen koskemasta luomien ihoa. Näytetikku suljetaan bakteerikuljetusputkeen (geeli, M40™ Transystem).
  • Virtsa
    • Näyte tulisi ottaa mahdollisimman puhtaasta keskivirtsasta tai mieluiten punktoimalla. Koko virtsa lähetetään Urine CCM/cultureputkessa tai kylmälähetyksenä lisäaineettomassa putkessa. Virtsanäyte voidaan lähettää myös Uricultille tai maljalle viljeltynä.

Myös anaerobibakteerit säilyvät bakteerinäytteenotto- ja -kuljetusputkissa (geeli, M40™ Transystem). Näyte voidaan ottaa myös ilmattomaan ruiskuun tai anaerobiampulliin, jos infektionaihettajaksi epäillään ensisijaisesti obligatorisesti anaerobia bakteeria.

Menetelmä:

Lähetetietojen perusteella näytealueella patogeeneina pidettävien mikrobien viljely yleis- ja selektiivisillä elatusaineille. Todennäköiset patogeenit tunnistetaan, ei tyypitetä. Tulkinta tulee aina suhteuttaa kliiniseen kuvaan. 

Virhelähteet:

  • Kuivunut näyte
  • Kontaminoitunut näyte tai runsas normaalifloora
  • Ennen näytteenottoa aloitettu antibioottilääkitys
  • Vanhentunut näyte tai säilytetty lämpimässä
  • Näyte on otettu tai toimitettu väärin
  • Riittämätön näytemäärä
  • Anaerobibakteerin elinkyvyn heikkeneminen kuljetuksen aikana

Lähteet:

Markey B, Leonard F, Archambault M, Cullinane A, Maguire D. 2013. Clinical Veterinary Microbiology, 2nd Edition.
Elintarviketurvallisuusvirasto Evira ja Helsingin yliopiston eläinlääketieteellinen tiedekunta. 05/2016. MIKROBILÄÄKKEIDEN KÄYTTÖSUOSITUKSET ELÄINTEN TÄRKEIMPIIN TULEHDUS- JA TARTUNTATAUTEIHIN
CLSI. Performance Standards for Antimicrobial Disk and Dilution Susceptibility Tests for Bacteria Isolated From Animals, 3rd ed. CLSI supplement VET01S. Wayne, PA: Clinical and Laboratory Standards Institute; 2015.
EUCAST. The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters.Version 6.0, 2016.
Albihn A, Båverud V, Magnusson U. 2003; Uterine Microbiology and Antimicrobial Susceptibility in Isolated Bacteria from Mares with Fertility Problems. Acta Veterinaria Scandinavica 44:121-129
Brooks D E. 2002; Equine Ophthalmology. AAEP PROCEEDINGS Vol. 48

 

  • Suomalaista palvelua

  • Sieltä saat tuoreinta tietoa ja uusimmat kuulumisemme.

    Liity joukkoomme

  • Asiakkaamme kertovat:

    "Erittäin nopeaa ja helppoa asioida teidän kanssa. Näytepaketti toimitettiin kotiin ja näyte oli helppo ottaa ja lähettää analyysiin. Ehdottomasti suosittelen palveluanne."